59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0404 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
397 aa  800    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  45.15 
 
 
394 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.64 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  40 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  38.87 
 
 
354 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  37.27 
 
 
367 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  37.5 
 
 
443 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  28.71 
 
 
402 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.01 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  25.07 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.93 
 
 
212 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 
319 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.72 
 
 
208 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.47 
 
 
197 aa  53.1  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.64 
 
 
507 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.86 
 
 
530 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.1 
 
 
200 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.36 
 
 
197 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.81 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.48 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  39.71 
 
 
212 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  34.88 
 
 
215 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.03 
 
 
202 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.36 
 
 
200 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
194 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.23 
 
 
499 aa  46.2  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  32.2 
 
 
537 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.38 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34 
 
 
193 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  23.12 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.68 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  32.23 
 
 
257 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.89 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.48 
 
 
200 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.44 
 
 
256 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.43 
 
 
226 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.43 
 
 
226 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.88 
 
 
198 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
192 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.84 
 
 
204 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  32 
 
 
193 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.81 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2499  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  36.26 
 
 
277 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00310356  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  28.74 
 
 
233 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.23 
 
 
231 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.23 
 
 
231 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.23 
 
 
231 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 
203 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.76 
 
 
195 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 
655 aa  43.1  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 
204 aa  43.1  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.6 
 
 
236 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.41 
 
 
247 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.03 
 
 
221 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.76 
 
 
195 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.2 
 
 
259 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>