63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3874 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  75.66 
 
 
233 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  79.12 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.29 
 
 
226 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  70.79 
 
 
226 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  73.27 
 
 
226 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.78 
 
 
226 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  73.02 
 
 
231 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.43 
 
 
231 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.43 
 
 
231 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  71.43 
 
 
231 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  67.01 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.87 
 
 
229 aa  247  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  72.34 
 
 
276 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.34 
 
 
229 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.34 
 
 
229 aa  244  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.34 
 
 
229 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.34 
 
 
229 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  72.34 
 
 
229 aa  244  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  148  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.71 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.5 
 
 
428 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5669  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.68 
 
 
291 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.109368 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.65 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.35 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  23.27 
 
 
257 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  38.03 
 
 
308 aa  51.6  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
396 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.4 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.67 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
259 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  29.27 
 
 
354 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
259 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  38.1 
 
 
289 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.91 
 
 
259 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  30.95 
 
 
385 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  40.79 
 
 
255 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  34.83 
 
 
359 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.42 
 
 
372 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 
318 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01260  cardiolipin synthase, putative  27.5 
 
 
341 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  27.98 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 
397 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.1 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
530 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
315 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4074  hypothetical protein  29.89 
 
 
310 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.74 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2777  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00563136  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  30.26 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2341  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.11 
 
 
202 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  30.77 
 
 
277 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.76 
 
 
507 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.1 
 
 
219 aa  41.6  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>