50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1356 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  79.22 
 
 		 252 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  57.81 
 
 		 256 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  60.32 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.25 
 
 		 273 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.02 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 		 410 aa  62  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  29.82 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.82 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.95 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.98 
 
 		 655 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.79 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.37 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  43.24 
 
 		 359 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.42 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  30.21 
 
 		 525 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  34.07 
 
 		 537 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0994  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.59 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611654 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.49 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.25 
 
 		 507 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.12 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  30.43 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  31.86 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 200 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.47 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.8 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 685 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.04 
 
 		 650 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.04 
 
 		 499 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.36 
 
 		 372 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  31.48 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.21 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.29 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.71 
 
 		 193 aa  42  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>