59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2746 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
396 aa  802    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  45.64 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  45.05 
 
 
394 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  45.17 
 
 
385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  40.97 
 
 
354 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  38.92 
 
 
367 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  37.03 
 
 
443 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  37.83 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.66 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  30.53 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.36 
 
 
212 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.69 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.83 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.4 
 
 
208 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.26 
 
 
200 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.46 
 
 
221 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.96 
 
 
247 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  37.21 
 
 
215 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  32.2 
 
 
233 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.93 
 
 
205 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.35 
 
 
197 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04740  diacylglycerol cholinephosphotransferase, putative  36.15 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.286986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.4 
 
 
202 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.46 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.65 
 
 
194 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
210 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.84 
 
 
198 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.68 
 
 
226 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  37.93 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.36 
 
 
233 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.02 
 
 
265 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.02 
 
 
210 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.8 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
499 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
216 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
226 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0610  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.94 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.84 
 
 
231 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.24 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  29.11 
 
 
193 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.72 
 
 
210 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  31.37 
 
 
225 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  34.29 
 
 
277 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
216 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 
200 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
193 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5279  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.82 
 
 
279 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.92 
 
 
204 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1657  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.01 
 
 
266 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 
192 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0504  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  34.85 
 
 
253 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.5 
 
 
223 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5671  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.97 
 
 
685 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0603036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>