54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2238 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  745    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  58.81 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  45.81 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  42.2 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.92 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  37.98 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.27 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  35.14 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.62 
 
 		 429 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  29.81 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.63 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3836  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1796  phosphatidylserine synthase  34.83 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2283  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2244  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2291  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  29.77 
 
 		 222 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1729  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.83 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.37 
 
 		 507 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.98 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1345  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferse  34.07 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1340  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00208453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1194  putative integral membrane protein  34.48 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0666714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0539  hypothetical protein  30.99 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0515  hypothetical protein  30.99 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33864  predicted protein  31.3 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0421094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.34 
 
 		 655 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.63 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  34.25 
 
 		 225 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.48 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.15 
 
 		 530 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3495  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.03 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000947375  hitchhiker  0.00194912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0470  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4691  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.182636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0885  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.83 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.22 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0529  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  32.94 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  0.417482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  31.68 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.67 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.83 
 
 		 193 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.53 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.95 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1720  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.047283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0564  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  24.42 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0610  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  29.76 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2600  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5407  phosphatidylserine synthase  32.97 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0504635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.11 
 
 		 205 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3325  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 270 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62120  phosphatidylserine synthase  32.97 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0144145 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0552  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  23.84 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  0.168906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>