29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2923 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 429 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1251  hypothetical protein  27.55 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.282628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1682  hypothetical protein  30.67 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.075067  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44350  hypothetical protein  28.61 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2238  hypothetical protein  28.62 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2746  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.66 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.01 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3062  hypothetical protein  29.89 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1307  hypothetical protein  31.58 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.618243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  26.24 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.71 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.45 
 
 		 507 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.26 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.63 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.69 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.13 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.42 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.72 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.18 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.63 
 
 		 301 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.01 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.13 
 
 		 193 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.45 
 
 		 236 aa  44.3  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  33.64 
 
 		 537 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.54 
 
 		 655 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 231 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 231 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.87 
 
 		 231 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>