66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1194 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.61 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.73 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2070  hypothetical protein  29.71 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.83 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3067  putative phosphatidyltransferase  40 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.802926  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.41 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1031  hypothetical protein  37.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.03 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  28.42 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.05 
 
 		 499 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.97 
 
 		 192 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.89 
 
 		 203 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  29.93 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.45 
 
 		 226 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.53 
 
 		 233 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2553  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  33.61 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0204712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.66 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.59 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  28.33 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.25 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5003  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.71 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.3 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.18 
 
 		 194 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.14 
 
 		 507 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.58 
 
 		 530 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4168  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.59 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866648  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.55 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2923  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.57 
 
 		 429 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.84 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.84 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.36 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0640  hypothetical protein  29.66 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0408  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.52 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5066  CDP-diacylglycerol/serineO- phosphatidyltransfera se  33.06 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.426955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.36 
 
 		 205 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11110  phosphatidylglycerophosphate synthase  35.29 
 
 		 193 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.78 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.48 
 
 		 205 aa  43.9  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0365  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.98 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 		 195 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.48 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.05 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.76 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.48 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.42 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  31.63 
 
 		 193 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.97 
 
 		 655 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2499  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  38.27 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00310356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3077  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.37 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000136505  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4489  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.42 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.21 
 
 		 428 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1264  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  35.37 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000564242  hitchhiker  0.000000000164148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>