67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1432 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  98.54 
 
 		 206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  96.6 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  96.12 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  96.6 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  96.6 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  96.6 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  96.12 
 
 		 206 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  82.93 
 
 		 205 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  60.49 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02681  hypothetical protein  63.37 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  58.25 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2771  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.59 
 
 		 205 aa  236  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145261 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.05 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003796  putative cytochrome oxidase  60.2 
 
 		 203 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0390  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  51.94 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  58.13 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.75 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.76 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.56 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3888  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  49.24 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0132  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  47.32 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0492  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  43.52 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00925403  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0073  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  46.24 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2696  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.44 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.751825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1831  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  48.45 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.492911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2531  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  52.02 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0198  phosphatidylglycerophosphate synthase  47.94 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.620186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  50.71 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.262552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2067  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.76 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4230  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.1 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1238  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.67 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3143  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.75 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  28.92 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  30.9 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  29.5 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.43 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3334  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.08 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.733387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.22 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.93 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  40 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.56 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.56 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  23.68 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  37.21 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.58 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.78 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1115  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  36.99 
 
 		 304 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  37.62 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  34.92 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15400  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.27 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0253477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  38.61 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  25.35 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0358  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0166511  normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.65 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  28.89 
 
 		 218 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00437888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  32.61 
 
 		 265 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2315  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  36.56 
 
 		 207 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0444691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.98 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.91 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0295  CDP-alcohol phosphatidyl transferase  31.11 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0759  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  34.25 
 
 		 301 aa  41.2  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00372597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>