169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1568 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  92.91 
 
 		 296 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  92.91 
 
 		 296 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  92.91 
 
 		 296 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  92.91 
 
 		 296 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  89.53 
 
 		 296 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  89.19 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  89.19 
 
 		 296 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  88.18 
 
 		 296 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  79.66 
 
 		 296 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  74.66 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  78.38 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  77.29 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  77.97 
 
 		 296 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  78.31 
 
 		 297 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  75.68 
 
 		 296 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  45.42 
 
 		 295 aa  257  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  45.07 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  43.66 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  45.42 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  44.75 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  44.75 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  44.75 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  42.71 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  46.69 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  41.84 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  42.18 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  41.36 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  42.18 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  42.18 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  42.18 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  43.05 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  40.96 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  35.14 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  34.78 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  31.85 
 
 		 139 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  36.52 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  36.52 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  34.88 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  36.79 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  35.83 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  32.58 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  33.08 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  33.05 
 
 		 138 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  27.83 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  33.58 
 
 		 132 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  36.94 
 
 		 135 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  33.91 
 
 		 140 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  32.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 135 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  32.76 
 
 		 129 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  35 
 
 		 181 aa  53.5  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  35.16 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  33.93 
 
 		 133 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 133 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  31.33 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  34.52 
 
 		 146 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.03 
 
 		 137 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 134 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 127 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  33.64 
 
 		 149 aa  52.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  35.29 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  33.68 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  31.58 
 
 		 143 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  29.79 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  33.87 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  35.65 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  32.71 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  33.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  34.82 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  31.86 
 
 		 159 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 132 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 132 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  31.03 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>