250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1390 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  270  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  266  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  45.67 
 
 
139 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  46.15 
 
 
138 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  44.44 
 
 
152 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  41.22 
 
 
132 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  40.8 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  44.17 
 
 
142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  40 
 
 
129 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  40.8 
 
 
130 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  45.24 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  46.67 
 
 
127 aa  110  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.55 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  44.62 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  44.09 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  45.45 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  44.62 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  43.4 
 
 
135 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  46.46 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  39.37 
 
 
131 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  43.31 
 
 
132 aa  107  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  41.8 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  45.08 
 
 
139 aa  105  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  45.83 
 
 
131 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  45.67 
 
 
131 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  38.17 
 
 
125 aa  104  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  50 
 
 
130 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  44.26 
 
 
138 aa  105  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  40.16 
 
 
137 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  41.73 
 
 
157 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  39.67 
 
 
128 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  43.7 
 
 
131 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  41.8 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  41.46 
 
 
132 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  42.28 
 
 
132 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  42.28 
 
 
132 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  44.55 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  42.98 
 
 
132 aa  98.6  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  44.26 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  43.85 
 
 
179 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  41.13 
 
 
132 aa  98.2  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  43.8 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  40.62 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  40.5 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  42.52 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  39.23 
 
 
135 aa  96.7  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  41.98 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  42.37 
 
 
131 aa  95.9  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.08 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  40.83 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  45.05 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  36.36 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  40.98 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  43.97 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  42.02 
 
 
135 aa  94  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  39.2 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  39.34 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  38.84 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  38.76 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  40.77 
 
 
130 aa  92  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  42.15 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  41.73 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  35.48 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  37.4 
 
 
175 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  36.59 
 
 
130 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  41.32 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  40.8 
 
 
135 aa  89  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  37.93 
 
 
133 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  46 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  43.4 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  38.76 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  40.65 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.64 
 
 
582 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  40.83 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  44.83 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  42.74 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  37.1 
 
 
134 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  36.36 
 
 
134 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  36.36 
 
 
134 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  36.8 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  37.1 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  36 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  37.27 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  36.44 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  37.61 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  43.4 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>