170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2048 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  89.83 
 
 		 296 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  82.03 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  80 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  80 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  80 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  80 
 
 		 296 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  80 
 
 		 296 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  79.66 
 
 		 296 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  79.32 
 
 		 296 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  79.32 
 
 		 296 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  78.98 
 
 		 296 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  78.31 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  76.95 
 
 		 297 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  70.17 
 
 		 298 aa  447  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  73.9 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  46.13 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  45.42 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  45.07 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  47.14 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  42.71 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  43.73 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  43.39 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  43.88 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  43.88 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  44.41 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  35.68 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  32.85 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  35.07 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  35.16 
 
 		 135 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  35.65 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  37.17 
 
 		 135 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  35.45 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  34.09 
 
 		 133 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  32.26 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  35.25 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  31.51 
 
 		 144 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  30.08 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  33.93 
 
 		 127 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 135 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  30.53 
 
 		 151 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  26.96 
 
 		 139 aa  53.9  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 134 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  32.81 
 
 		 129 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  38.75 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  31.93 
 
 		 175 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  30.37 
 
 		 135 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 136 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 131 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 127 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  31.67 
 
 		 134 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  32.33 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  29.6 
 
 		 134 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  33.93 
 
 		 129 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  31.3 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  32.71 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  31.53 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  32.79 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  33.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  31.03 
 
 		 138 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  32.22 
 
 		 146 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  30.94 
 
 		 151 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  33.63 
 
 		 133 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  31.11 
 
 		 133 aa  50.1  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  31.4 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  30.22 
 
 		 131 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  30.22 
 
 		 131 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  30.22 
 
 		 131 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  30.22 
 
 		 131 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  30.22 
 
 		 131 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 137 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>