185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02072 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  99.66 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  99.66 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  99.32 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  87.37 
 
 		 294 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  87.41 
 
 		 294 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  87.07 
 
 		 294 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  87.07 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  87.07 
 
 		 294 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  86.39 
 
 		 294 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  65.07 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  65.07 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  65.07 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  66.1 
 
 		 294 aa  359  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 295 aa  319  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 296 aa  315  7e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  57.24 
 
 		 296 aa  308  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  60.75 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  51.41 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  49.65 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  48.24 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  48.28 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  45.92 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  45.24 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  45.69 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  44.9 
 
 		 296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  45.24 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  44.22 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  44.56 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  46.07 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  35.47 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  34.19 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.29 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.61 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  37.39 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  30.46 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  34.33 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  32.46 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  36.44 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  36.44 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  38.05 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  36.84 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 152 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  32.89 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  36.94 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  35.34 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  35.45 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 131 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 128 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  35.24 
 
 		 132 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 133 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  36.13 
 
 		 175 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  32.77 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 132 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  36.84 
 
 		 135 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 132 aa  52.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 181 aa  52.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  30.25 
 
 		 133 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  36.9 
 
 		 138 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  37.97 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  27.83 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  37.39 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  30.51 
 
 		 134 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  31.11 
 
 		 129 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  30.51 
 
 		 134 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  31.21 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  32.23 
 
 		 138 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  30.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  35.45 
 
 		 136 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  35.09 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  34.65 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  31.53 
 
 		 134 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 135 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  35.77 
 
 		 145 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>