141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2746 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  100 
 
 
294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  87.03 
 
 
294 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  87.37 
 
 
294 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  87.03 
 
 
294 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  87.03 
 
 
294 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  87.03 
 
 
294 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  86.05 
 
 
294 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  86.05 
 
 
294 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  86.39 
 
 
294 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  86.39 
 
 
294 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  65.41 
 
 
294 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  65.41 
 
 
294 aa  364  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  65.41 
 
 
294 aa  364  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  67.01 
 
 
294 aa  361  8e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  62.12 
 
 
295 aa  325  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  60 
 
 
296 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  56.46 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  60.75 
 
 
294 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  51.41 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  50 
 
 
295 aa  279  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  53.03 
 
 
303 aa  275  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  48.59 
 
 
295 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  47.18 
 
 
302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  45.24 
 
 
296 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  44.01 
 
 
298 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  43.54 
 
 
296 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  44.22 
 
 
296 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  44.22 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  44.22 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  44.22 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  44.22 
 
 
296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  44.9 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  42.86 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  42.52 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  42.18 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  42.86 
 
 
296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  42.86 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  43.88 
 
 
296 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  44.57 
 
 
296 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  37.02 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  34.55 
 
 
131 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  38.46 
 
 
139 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  29.14 
 
 
138 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.17 
 
 
135 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  35.04 
 
 
132 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  38.05 
 
 
143 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  37.27 
 
 
135 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  33.58 
 
 
139 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  34.21 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  33.33 
 
 
151 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  32.14 
 
 
133 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  35.45 
 
 
139 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  37.04 
 
 
129 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  34.19 
 
 
127 aa  53.5  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  34.51 
 
 
132 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  34.51 
 
 
132 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  35.04 
 
 
131 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  34.71 
 
 
138 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  36.7 
 
 
125 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  34.23 
 
 
136 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  36.21 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  32.46 
 
 
133 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  37.84 
 
 
135 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  35.09 
 
 
133 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  31.73 
 
 
129 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  31.73 
 
 
129 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  31.73 
 
 
129 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  33.93 
 
 
132 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  35.85 
 
 
128 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  27.43 
 
 
139 aa  49.3  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  33.05 
 
 
138 aa  48.9  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  35.71 
 
 
138 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  34.45 
 
 
144 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  38.46 
 
 
133 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04940  cytidine deaminase, putative  27.27 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896337  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  34.75 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  31.06 
 
 
129 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  34.17 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  34.55 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  33.94 
 
 
135 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  33.64 
 
 
132 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  35.78 
 
 
136 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  37.66 
 
 
137 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  37.84 
 
 
138 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  37.5 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  33.03 
 
 
127 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  30.5 
 
 
142 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  29.22 
 
 
159 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  34.43 
 
 
140 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  34.86 
 
 
132 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.93 
 
 
388 aa  45.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  34.15 
 
 
133 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  31.53 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2461  cytidine deaminase  40.38 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.17 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>