241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1779 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  100 
 
 		 133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  68.46 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  65.12 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  65.12 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  65.12 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  63.85 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  63.16 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  63.85 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  61.6 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  58.14 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  60.9 
 
 		 138 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  59.2 
 
 		 131 aa  156  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  56.06 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  54.76 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  56.59 
 
 		 234 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  56.3 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  55.81 
 
 		 234 aa  150  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  59.52 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  57.36 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  53.91 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  58.46 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.14 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  59.35 
 
 		 199 aa  140  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  54.4 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  51.88 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  53.52 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  57.26 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  56.35 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  50.38 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  56.39 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  52.71 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  48.51 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.09 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  45.16 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 131 aa  96.7  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  45.13 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  38.17 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  42.42 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  38.17 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.59 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  47.71 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  38.58 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  36.84 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  35.48 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  44.54 
 
 		 120 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  43.2 
 
 		 135 aa  85.9  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  44.14 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  43.1 
 
 		 132 aa  84.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  40.34 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  50 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  39.5 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  42.15 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  38.79 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 145 aa  83.6  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 129 aa  83.6  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 132 aa  83.6  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  40.87 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  35.9 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 388 aa  83.6  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  36 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  42.07 
 
 		 151 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  46.67 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  33.59 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  43.86 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>