239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  59.54 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  56.93 
 
 
133 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  65.25 
 
 
143 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  57.25 
 
 
129 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  56.49 
 
 
136 aa  147  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  54.68 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  57.04 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  65.79 
 
 
138 aa  143  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  61.54 
 
 
136 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  54.2 
 
 
133 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  55.73 
 
 
131 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  55.93 
 
 
145 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  58.96 
 
 
138 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  54.74 
 
 
137 aa  136  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  48.99 
 
 
158 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  53.79 
 
 
199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  50.75 
 
 
140 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  60.53 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  51.13 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  51.13 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  49.62 
 
 
140 aa  130  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  49.26 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  54.89 
 
 
136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  51.61 
 
 
132 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  49.62 
 
 
234 aa  126  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  48.51 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  48.87 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  49.62 
 
 
234 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  48.12 
 
 
133 aa  123  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  50.74 
 
 
138 aa  123  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  47.59 
 
 
159 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.17 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  53.1 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  47.73 
 
 
142 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  41.48 
 
 
139 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  44.78 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  39.19 
 
 
139 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  48.31 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.96 
 
 
135 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  44.78 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  33.33 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  38.46 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  35.82 
 
 
133 aa  90.5  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  43.36 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  37.31 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  43.07 
 
 
136 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  37.59 
 
 
138 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  38.17 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  39.1 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.37 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  37.04 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  36.99 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  36.3 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  41.96 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  35.61 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  35.61 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  43.48 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  35.34 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  45.13 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  43.65 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  35.88 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  40.31 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  40.15 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  40.31 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  37.59 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  40.31 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  34.85 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  38.06 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  31.39 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  34.62 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  35.88 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  42.42 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  39.37 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  38.53 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  40.3 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  35.29 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  38.6 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  37.5 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  37.12 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  36.84 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  33.08 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.12 
 
 
138 aa  76.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  30.88 
 
 
131 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  41.48 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>