235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3655 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  100 
 
 		 131 aa  269  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  58.59 
 
 		 152 aa  166  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  52.31 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  52.31 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  52.34 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  47.11 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  46.72 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  48.39 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  49.17 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  49.17 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  47.5 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  48.36 
 
 		 130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  50 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 132 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  45.16 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  46.51 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  46.51 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  46.51 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  45.6 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  45.45 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  43.33 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  37.1 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  44 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  41.46 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 145 aa  95.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  42.5 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  41.44 
 
 		 142 aa  94  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  45.83 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  44.17 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  48.18 
 
 		 136 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  43.61 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  37.7 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  52.75 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  43.44 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  39.5 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  38.58 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  37.1 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  47.2 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  48.84 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  43.64 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 388 aa  84.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  47.29 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  40.54 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  36.8 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2967  cytidine deaminase  44.95 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0779026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  37.1 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  44.04 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>