240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2967 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2967  cytidine deaminase  100 
 
 		 137 aa  269  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0779026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  97.79 
 
 		 137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  86.13 
 
 		 137 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  70.71 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  75.57 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  75.86 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  58.54 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  52.8 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  59.69 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  60.32 
 
 		 130 aa  127  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  46.83 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  58.73 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  56 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  56.35 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  53.12 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  52.17 
 
 		 140 aa  120  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  39.71 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  54.4 
 
 		 164 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  49.17 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  56.15 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  53.49 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  47.2 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  45.6 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  47.15 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  41.09 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  42.22 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  38.35 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  38.58 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  39.84 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  39.37 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  55.2 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.98 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  46.49 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  40.74 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  44.96 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50.89 
 
 		 582 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  45.97 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  39.66 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  49.07 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  47.86 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  48.21 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  42.31 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  45.67 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  44.27 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  44.19 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 131 aa  93.6  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  39.85 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  38.84 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  42.76 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 388 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>