252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1001 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  100 
 
 		 137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  65.08 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  59.54 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  60.77 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  65.08 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  64 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  55.4 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  64 
 
 		 131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  60.32 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  64.52 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  63.2 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  60 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  59.38 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  58.91 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  60.16 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  56.82 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  60.16 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  57.81 
 
 		 132 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  58.73 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  61.16 
 
 		 129 aa  149  8e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  53.79 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  56.82 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  59.68 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  59.68 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  59.68 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  57.02 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  53.49 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  52.71 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  53.6 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  53.6 
 
 		 131 aa  141  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  51.22 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  53.33 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  54.92 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  53.33 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  56 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  56.8 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  49.62 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  53.72 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  49.63 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  55.2 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  50.37 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  52.38 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  50.41 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  50.41 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  54.1 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  55.2 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  52.07 
 
 		 135 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  50.41 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  58.72 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  44.6 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  50.41 
 
 		 136 aa  130  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  60.48 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  58.87 
 
 		 231 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  53.1 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  43.28 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  50 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  48.09 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  47.5 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  48.91 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  52.99 
 
 		 582 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  47.2 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  47.46 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  44.07 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  48.8 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  53.72 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  47.54 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  51.26 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  39.57 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  49.12 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  51.24 
 
 		 301 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  48.36 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  48.41 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  44.6 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  42.75 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  48.03 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  39.55 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  44.09 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>