194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0684 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  66.67 
 
 		 199 aa  193  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  66.18 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  61.76 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  57.45 
 
 		 234 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  60.14 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  60.87 
 
 		 131 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  58.7 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  52.94 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  57.14 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  59.57 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  58.82 
 
 		 136 aa  151  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  59.26 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  59.26 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  59.29 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  57.75 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  66.18 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  56.74 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  56.83 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  56.83 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  56.83 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  52.67 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  58.33 
 
 		 138 aa  140  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  53.68 
 
 		 144 aa  140  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  58.7 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  53.79 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  53.52 
 
 		 133 aa  137  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  55.8 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.29 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  53.96 
 
 		 133 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  53.85 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  55.15 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  55.47 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  40.28 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 135 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  36.88 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  46.04 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  40.85 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  43.07 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  46.28 
 
 		 134 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  44.14 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  37.06 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  46.48 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  35.77 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  44.72 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  39.46 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  34.97 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  36.88 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  40.4 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  43.48 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  39.26 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  39.42 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  35.25 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  39.86 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  39.46 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  35.46 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  40.6 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  34.25 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  35.25 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  30.71 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  33.09 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  29.66 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  30.5 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  35.34 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  37.24 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  36.89 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  38.41 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  32.03 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  38.57 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  38.96 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  39.39 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  30.66 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  35.46 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  42.86 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  37.04 
 
 		 388 aa  72  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  40.29 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  36.11 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  41.77 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  32.37 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>