226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1356 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  100 
 
 		 132 aa  266  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  70.23 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  65.15 
 
 		 234 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  65.15 
 
 		 234 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  67.44 
 
 		 199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  67.44 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  64.23 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  59.68 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  62.9 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  63.36 
 
 		 131 aa  159  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  66.39 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  63.41 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  65.6 
 
 		 135 aa  157  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  61.29 
 
 		 133 aa  156  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  64.23 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  61.29 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  62.7 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  64.23 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  59.23 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  64.62 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  64.23 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  62.1 
 
 		 140 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  59.29 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  60.47 
 
 		 138 aa  146  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  64.55 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  57.36 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  59.54 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  54.4 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  64.49 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  60.63 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  58.4 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  60 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.91 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  52.17 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  45.38 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  45.04 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  46.27 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  43.28 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  42.15 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  37.59 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  47.58 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  38.02 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  46.53 
 
 		 145 aa  90.5  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  51.79 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  43.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  48.86 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  45 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  45.45 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  37.7 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  34.33 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  39.53 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  42.24 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  38.52 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 		 582 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  35.43 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 388 aa  83.6  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2461  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  43.48 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  46.67 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.54 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  35.43 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40.6 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>