218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13346 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  100 
 
 		 133 aa  266  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  74.62 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  72.87 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  72.87 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  72.87 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  71.65 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  71.88 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  65.62 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  64.62 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  64.57 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  63.49 
 
 		 234 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  63.85 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  60.16 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  62.7 
 
 		 234 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  62.31 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  63.91 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  66.39 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  61.6 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  64.57 
 
 		 199 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  58.73 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  56 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  61.9 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  60.47 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  56.62 
 
 		 138 aa  143  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  60.16 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  56.83 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  55.04 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  58.33 
 
 		 143 aa  140  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.63 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  57.81 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  55.38 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  60.94 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  54.4 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  52.17 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  40.88 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  41.94 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  48.15 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  41.22 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  42.65 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  45.86 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  46.77 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  44.07 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  43.22 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  41.91 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  42.74 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  32.06 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  32.06 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  44.07 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  41.38 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  35.94 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  38.98 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  44.25 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  43.12 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  46.85 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  36.22 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0030  cytidine deaminase  38.36 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  45.45 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  39.37 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  43.1 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  48.42 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>