205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4421 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  100 
 
 		 129 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  96.12 
 
 		 129 aa  257  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  70.54 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  70.54 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  69.77 
 
 		 231 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  69.77 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  68.22 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  59.84 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  59.06 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  55.04 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  55.91 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  57.6 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  54.26 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  54.26 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  54.26 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  56.35 
 
 		 135 aa  150  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  57.48 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  55.12 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  55.91 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  56.8 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  53.6 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  52.03 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  51.97 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  51.61 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  53.98 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  50.4 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  49.19 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  50.4 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  50.43 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  54.39 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  53.57 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  49.57 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  49.57 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  58.04 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  53.17 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  51.18 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  48.8 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  48.41 
 
 		 388 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  45.6 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  45.6 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  52.73 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  44.96 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  49.53 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  50 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  48.82 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  45.24 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  51.56 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  48.78 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  47.24 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  48.78 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  44.09 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  47.15 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  43.08 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  43.44 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  46.72 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  46.62 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  46.4 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  55.2 
 
 		 301 aa  101  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  40.48 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  48 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  53 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  48.12 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  48.54 
 
 		 175 aa  98.2  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  49.12 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  38.6 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  47.97 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  42.11 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>