241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0968 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  69.29 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  69.29 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  69.29 
 
 		 138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  68.46 
 
 		 133 aa  187  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  70.63 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  67.44 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  66.41 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  68.5 
 
 		 129 aa  183  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  68 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  66.4 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  65.62 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  64.96 
 
 		 138 aa  174  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  65.65 
 
 		 135 aa  174  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  71.43 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  65.91 
 
 		 137 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  62.02 
 
 		 234 aa  169  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  61.24 
 
 		 234 aa  168  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  60.47 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  59.84 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  63.78 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  62.9 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  58.14 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  63.28 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  62.6 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  61.9 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  59.57 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  65.04 
 
 		 199 aa  149  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  60.16 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.94 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  62.5 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  55.81 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  58.87 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  50.86 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  47.01 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  44.95 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  44.35 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  36.15 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 132 aa  84.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  36.29 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  40.71 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  33.33 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  36.15 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  39.37 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  40.18 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  34.38 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  36.07 
 
 		 388 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  35.83 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  48.84 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  40.34 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  37.12 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  35 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  40.44 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  34.92 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  34.35 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  37.84 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  34.96 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  43.65 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  34.35 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  37.78 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  32.09 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  37.59 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>