231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4051 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  100 
 
 		 151 aa  298  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  55.04 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  51.08 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  47.86 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.88 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  39.55 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  37.96 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  39.57 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  44.03 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  42.76 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  42.47 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  45.52 
 
 		 388 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  33.1 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  44.03 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  36.55 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  39.72 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  43.88 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  40.29 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  40.14 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  45 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.73 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.29 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  38.3 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  43.24 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  41.79 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  41.22 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  44.6 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  41.78 
 
 		 234 aa  88.2  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  44.36 
 
 		 199 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  45.83 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  42.34 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  37.41 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  38.17 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  38.13 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  46.4 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  40.29 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.14 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  40.56 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  42.18 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  40.88 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  41.48 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  43.54 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  43.7 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  40.85 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  43.7 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  40.14 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  43.24 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  40 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  47 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  43.7 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  43.24 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  43.24 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  44.92 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  39.01 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  42.07 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  41.45 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  40.74 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  40.71 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  38.3 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  36.3 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  35.82 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  36.3 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  42.54 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  43.66 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>