227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0790 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  100 
 
 		 132 aa  276  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  48.46 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  52.85 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  52.03 
 
 		 129 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  46.46 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  47.29 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  49.59 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 152 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  48.76 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  42.28 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  41.22 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  48.41 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  43.09 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 135 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  39.37 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  43.44 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  34.35 
 
 		 133 aa  106  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  42.37 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  39.34 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40.65 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  37.6 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  42.98 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  47.79 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  42.42 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  42.48 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  45.45 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  37.9 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  40.77 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  41.13 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  42.98 
 
 		 130 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  41.6 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  42.37 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  42.98 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  38.71 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  34.09 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  39.66 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  46.73 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  39.02 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  38.71 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  37.1 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.35 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.736977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  34.71 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  38.64 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  39.37 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 388 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  33.07 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  34.82 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  40.65 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  37.6 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  36.51 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  36.51 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  37.7 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1554  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  34.4 
 
 		 133 aa  87.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  37.7 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>