187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1554 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1554  cytidine deaminase  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  63.12 
 
 		 160 aa  227  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  48.73 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0030  cytidine deaminase  50.68 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.92 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  47.73 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  46.97 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.88 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  45.45 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  47.79 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  39.29 
 
 		 137 aa  94.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.13 
 
 		 135 aa  93.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  43.61 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  39.72 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  38.85 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  40.71 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  43.28 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  38.97 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  38.41 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  39.44 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  43.07 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  37.86 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  40.74 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  41.61 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 132 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  44.76 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 132 aa  88.2  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  41.01 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  38.57 
 
 		 135 aa  87.8  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  37.58 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  37.78 
 
 		 130 aa  87  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  37.96 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  42.11 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  45.8 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  42.11 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 142 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  37.86 
 
 		 134 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  37.84 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  39.42 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  39.26 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 128 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  46.46 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  84  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 388 aa  84  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  38.64 
 
 		 132 aa  84  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  39.86 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  37.67 
 
 		 137 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  39.47 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  39.72 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  38.41 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  41.04 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  39.26 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  43.43 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  40.15 
 
 		 582 aa  81.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  34.46 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  35.82 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  39.57 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  36.99 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  36.94 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  36.44 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  33.81 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  35.82 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  37.04 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.15 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.736977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  42.98 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  34.06 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  42.57 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  38.85 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  40.82 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>