204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl143 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  41.35 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  39.1 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  39.1 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  40.32 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  37.98 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  37.68 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.08 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  39.2 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  39.47 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  38.6 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  43.7 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  38.24 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  34.35 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  41.38 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.07 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  44.34 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  31.58 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  34.68 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  39.83 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  37.1 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  39.83 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  37.72 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  33.83 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  34.92 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  34.59 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 139 aa  89.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  40.8 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  38.02 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  33.59 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  34.92 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  38.35 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  34.92 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  40.8 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  37.59 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  36.64 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  34.96 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  38.46 
 
 		 582 aa  87  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  38.53 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  42.37 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  38.89 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  41.38 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 388 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  31.11 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  39.5 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  31.54 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  31.54 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  38.53 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  31.75 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  40 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  36.43 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  31.78 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  36.23 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  38.14 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  35.34 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  32.35 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  30.47 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  35.96 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  37.9 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>