234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2867 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 		 135 aa  278  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  47.62 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  41.79 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  43.08 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf331  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0499052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.08 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  43.08 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  43.08 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  42.62 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  41.32 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  40.48 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  40.29 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  38.81 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  36.84 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  36.67 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 139 aa  84.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  40 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  38.06 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  35.38 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.32 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  37.59 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  41.88 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  34.81 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.7 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  39.32 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  41.8 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  40.17 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  35.9 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  36.96 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  35.65 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  37.6 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  36.51 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1339  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.79 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  36.15 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  36.89 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_002950  PG0030  cytidine deaminase  36.8 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  32.09 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  34.59 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  37.72 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  34.59 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  34.59 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  42.15 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  39.83 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 388 aa  72  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  36.07 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  34.43 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  39.32 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  36.44 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  34.71 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  34.65 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>