173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf331 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf331  cytidine deaminase  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0499052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.41 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  33.86 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  38.98 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  29.46 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  29.46 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  34.45 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  37.27 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  31.93 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  32.28 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  32.82 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  32.26 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  33.9 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  33.9 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  34.38 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  34.38 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  34.68 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  34.11 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  31.34 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  33.87 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  32.06 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  33.88 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  31.78 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  37.72 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  34.19 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  34.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  30.77 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  35.14 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  32.28 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  32.12 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  32.48 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  31.09 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  30.25 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  31.09 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  38.04 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  31.53 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  31.86 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  35.19 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  31.25 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  35.16 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  30.88 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  38.04 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  32.28 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  33.68 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  32 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  31.5 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  33.02 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  31.4 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  36.94 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  31.03 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  31.67 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  31.45 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  29.75 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  33.63 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  33.67 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  30.19 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  34.45 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  32.41 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  30.83 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  29.69 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  30.19 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>