245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1135 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  100 
 
 		 134 aa  281  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  80.45 
 
 		 134 aa  233  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  80.45 
 
 		 134 aa  233  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  51.94 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  50 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  52.8 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  50.77 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  55.2 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  52 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  48.09 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  46.83 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  46.83 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  46.83 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  47.24 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  50 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  48.06 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  49.14 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  49.18 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  46.92 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  51.85 
 
 		 231 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  51.85 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  41.35 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  50 
 
 		 582 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  49.57 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  50.43 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  45.6 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  50 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  47.11 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  47.54 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  47.01 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  45.04 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  45.67 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  44.64 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  45 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  41.03 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  45 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  43.44 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  42.02 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.3 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  44.83 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  44.83 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  44.63 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  40.98 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  40.88 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  41.23 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  43.65 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  45.08 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 388 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  39.53 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  40.8 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  45.9 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  44.8 
 
 		 160 aa  98.6  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  43.97 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  42.74 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  45.3 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  41.03 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 129 aa  96.7  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  37.82 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0030  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  39.17 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  48.39 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  40.71 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  34.71 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  39.17 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  39.17 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.13 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.14 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  44.92 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>