247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0827 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  100 
 
 		 140 aa  289  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  48.39 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  52.14 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  55.36 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  48.51 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  46.92 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  42.37 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  48.84 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  48.44 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  40 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  53.78 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  52.52 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  47.83 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  40 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  42.61 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  43.86 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  48.41 
 
 		 179 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  43.85 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  43.97 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  41.74 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  41.94 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  43.33 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  36.96 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  39.82 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  38.69 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  43.36 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 388 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  36.5 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  47.2 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2967  cytidine deaminase  52.17 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0779026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  39.66 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  47.06 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  39.09 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  39.09 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  35.82 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  36.43 
 
 		 175 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  47.06 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  54.46 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  47.06 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.5 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  46.03 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  40.35 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  38.14 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  38.6 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  34.35 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  36.43 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  43.33 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  37.72 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  37.32 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  37.23 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  33.58 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  37.29 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  37.93 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  33.58 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  36.8 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  36.23 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  37.93 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  35.94 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  36.07 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  36.07 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>