253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0331 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  100 
 
 
131 aa  270  7e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  49.62 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  49.24 
 
 
139 aa  135  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  49.62 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  49.21 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  46.56 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  49.61 
 
 
132 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  48.84 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  48 
 
 
133 aa  127  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  48.44 
 
 
142 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  48.41 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  47.41 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  46.92 
 
 
132 aa  123  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  46.92 
 
 
133 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  46.83 
 
 
132 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  118  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  46.62 
 
 
175 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  44.88 
 
 
129 aa  118  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  51.61 
 
 
131 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  47.69 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  45.38 
 
 
132 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  47.29 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  43.75 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  44.53 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  47.5 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  47.5 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  45.74 
 
 
159 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  41.98 
 
 
143 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  46.92 
 
 
131 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  43.75 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  42.75 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  43.65 
 
 
139 aa  111  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  44.26 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40.46 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  48.03 
 
 
138 aa  110  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  46.51 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  41.22 
 
 
138 aa  110  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.98 
 
 
388 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  45.08 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  46.77 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  42.86 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  43.8 
 
 
129 aa  108  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  40.15 
 
 
132 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  45 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  42.31 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  41.94 
 
 
130 aa  107  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  45.9 
 
 
129 aa  106  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  43.65 
 
 
133 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40.31 
 
 
138 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  43.9 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  43.9 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  43.9 
 
 
129 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  45.6 
 
 
131 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  41.22 
 
 
151 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  43.75 
 
 
136 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  40.94 
 
 
127 aa  103  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  39.1 
 
 
142 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  37.98 
 
 
129 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  40.48 
 
 
129 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  43.24 
 
 
132 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  44.8 
 
 
130 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  43.09 
 
 
125 aa  101  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  40.48 
 
 
129 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  37.21 
 
 
157 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  39.67 
 
 
136 aa  98.6  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  45.16 
 
 
130 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  45.54 
 
 
135 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  42.15 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  44.74 
 
 
135 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  44.44 
 
 
231 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  38.93 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  42.48 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  41.82 
 
 
125 aa  94.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  45.53 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  40.31 
 
 
135 aa  94  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  37.1 
 
 
132 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  42.98 
 
 
301 aa  93.6  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  37.4 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  39.06 
 
 
139 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>