204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1528 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  100 
 
 
130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  63.28 
 
 
132 aa  168  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  60.48 
 
 
129 aa  157  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  60.66 
 
 
131 aa  153  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  60.66 
 
 
131 aa  153  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  59.52 
 
 
131 aa  153  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  58.73 
 
 
131 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  58.73 
 
 
131 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  60.98 
 
 
129 aa  153  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  54.33 
 
 
129 aa  152  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  56.69 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  58.73 
 
 
131 aa  150  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  148  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  55.91 
 
 
132 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  55.56 
 
 
132 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  54.4 
 
 
159 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  55.56 
 
 
132 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  53.6 
 
 
137 aa  141  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  53.97 
 
 
133 aa  139  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  55.36 
 
 
132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  54.2 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  55.36 
 
 
582 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  50 
 
 
135 aa  130  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  48.84 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  51.64 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  52.89 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  49.61 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  48.82 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  56.78 
 
 
135 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  49.18 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  52.03 
 
 
129 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  52.03 
 
 
129 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  52.03 
 
 
129 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  51.56 
 
 
129 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  47.62 
 
 
132 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  49.19 
 
 
129 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  48.76 
 
 
127 aa  121  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  49.18 
 
 
127 aa  120  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  49.6 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  51.38 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  52.78 
 
 
231 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  43.18 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  49.18 
 
 
138 aa  117  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  51.2 
 
 
129 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  52.78 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  52.78 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  52.78 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  46.56 
 
 
138 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  52.78 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  52.78 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  45.9 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  52.29 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  47.5 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  51.59 
 
 
130 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  47.58 
 
 
131 aa  114  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  44 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  43.18 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  43.18 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  50.82 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  50.81 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  47.37 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  44.44 
 
 
135 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  48.36 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  45.52 
 
 
181 aa  110  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  42.52 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  42.52 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  46.72 
 
 
126 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  42.31 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  47.83 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  40.8 
 
 
139 aa  104  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  41.27 
 
 
149 aa  104  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  41.46 
 
 
139 aa  103  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  43.44 
 
 
128 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  42.74 
 
 
134 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  44.19 
 
 
175 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  43.8 
 
 
388 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  40.83 
 
 
157 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  42.15 
 
 
133 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  47.66 
 
 
128 aa  100  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  43.9 
 
 
152 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  44.63 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  50 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  48.15 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  41.46 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  42.4 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  39.45 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  38.76 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  39.32 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  41.6 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>