192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1339 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1339  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 134 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  37.6 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  37.6 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  39.83 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  31.85 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  37.9 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  36.72 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  44.09 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.79 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  35.48 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  40.91 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  33.87 
 
 		 138 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  42.39 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  34.68 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  40.24 
 
 		 135 aa  74.3  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  36.8 
 
 		 132 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  34.15 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  34.15 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  33.87 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  34.68 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  34.38 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  42.55 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  36.07 
 
 		 138 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  34.13 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  34.43 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  38.33 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  32.52 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  33.86 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  46.74 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  39.82 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  41.24 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  32.23 
 
 		 128 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  36.03 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  33.06 
 
 		 129 aa  67  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  34.62 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  42.99 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0622  cytidine deaminase  34.78 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  41.96 
 
 		 582 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  35.25 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  33.83 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  38.21 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  41.11 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  38.84 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  35.2 
 
 		 132 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  40.96 
 
 		 125 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  38.02 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  40.66 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  36.29 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  36.29 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  40.2 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1554  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  36.67 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  37.17 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  31.31 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  40.18 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  32.26 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  38.84 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  41.03 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  35.43 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  44.57 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  42.39 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  41.25 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  41.25 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  38.18 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  41.25 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  41.25 
 
 		 130 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.62 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>