217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1194 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.736977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  54.26 
 
 		 138 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  51.88 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  51.94 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  53.91 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  40.6 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  47.33 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  43.08 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  43.28 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  48.44 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  41.38 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  46.88 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  54.31 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  50 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  45.93 
 
 		 179 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  45.38 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  45.38 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  48.03 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  45.38 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  40.71 
 
 		 388 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  43.48 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  42.31 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  50 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  38.28 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  37.59 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  41.22 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  46.15 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  39.85 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1554  cytidine deaminase  40.58 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  38.28 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  40 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  44.07 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  35.94 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  35.88 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  46.15 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  39.39 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  45.59 
 
 		 140 aa  84.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  46.67 
 
 		 231 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  44.74 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.69 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 129 aa  84.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  41.61 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  41.18 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  39.39 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  38.89 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  37.68 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  43.48 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  39.02 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  42.22 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  43.59 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  34.85 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  45.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  45.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  45.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  45.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  45.54 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  35.66 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  32.81 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  32.81 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.44 
 
 		 582 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  39.69 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  36.64 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  38.93 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  38.76 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  41.54 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  34.65 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>