248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1838 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  63.06 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  58.82 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  46.51 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  48 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  46.46 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  48.8 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  44.19 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  47.66 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  45.31 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  50.39 
 
 		 388 aa  100  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  44.27 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  43.85 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  42.19 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  39.84 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  45.74 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  45.74 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  48.25 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  42.42 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  40.46 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  40 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  44.19 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  41.41 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  47.69 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  43.41 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  44.19 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  46.15 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  37.4 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  49.49 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  42.97 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  46.92 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  41.86 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  46.92 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  35.66 
 
 		 175 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  37.31 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  40.62 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  36.92 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  36.57 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  41.04 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  38.41 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  46.09 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  47.83 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  44.62 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  40 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 181 aa  84  7e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  47.32 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  37.21 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  43.48 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6435  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.11 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0667145  normal  0.662331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  43.85 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  41.03 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  35.38 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  46.49 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  36.15 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  44.64 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  37.01 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  46.55 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  44.03 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  38.24 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  48.03 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>