247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3945 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  100 
 
 		 136 aa  275  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  69.47 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  69.84 
 
 		 145 aa  185  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  66.17 
 
 		 145 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  64.66 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  67.97 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  66.92 
 
 		 137 aa  177  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  66.41 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  64.34 
 
 		 133 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  73.39 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  65.32 
 
 		 133 aa  167  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0811  cytidine deaminase  62.2 
 
 		 234 aa  167  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  61.9 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  65.35 
 
 		 145 aa  166  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  69.6 
 
 		 136 aa  166  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0755  cytidine deaminase  62.99 
 
 		 234 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  72.58 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  58.91 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4190  cytidine deaminase  63.36 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  61.03 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  61.03 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  61.03 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  68.52 
 
 		 147 aa  159  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  63.71 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5935  cytidine deaminase  60.31 
 
 		 199 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0116924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  61.29 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4843  cytidine deaminase  61.29 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  65.12 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  61.79 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13346  cytidine deaminase  60.47 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.19995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  57.26 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0684  cytidine deaminase  55.8 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07960  cytidine deaminase  65.74 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  54.89 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  41.98 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  45.52 
 
 		 145 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  43.18 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  44.17 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  43.33 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  45.87 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  48.36 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  42.4 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  42.06 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  38.76 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  37.88 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  43.26 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  42.52 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  43.33 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  43.36 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  39.34 
 
 		 388 aa  87.4  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  37.98 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.35 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  42.31 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  45.97 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  36.13 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  40.83 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  37.82 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  39.23 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  38.66 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  42.5 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  41.59 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  38.58 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  40.52 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  37.98 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  35.34 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  42.24 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  45.19 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  41.35 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  40.3 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  43.51 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  46.24 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  36.13 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  42.86 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  39.2 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  36.75 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  39.39 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  37.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>