115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1257 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  100 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  48.93 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  54.55 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  51.21 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  54.31 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  50.88 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  43.92 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  54.32 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  54.32 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  54.32 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  53.03 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  53.23 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  54.55 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  52.65 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  46.24 
 
 		 302 aa  238  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  50 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  44.41 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  40.68 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  45.83 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  47.83 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  43.39 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  44.07 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  43.39 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  43.05 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  43.05 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  43.05 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  43.05 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  43.39 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  42.71 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  42.71 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  45.85 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  35.27 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  34.86 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  41.38 
 
 		 152 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  36.28 
 
 		 140 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  34.82 
 
 		 131 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  31.07 
 
 		 142 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  30.43 
 
 		 151 aa  52.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  31.25 
 
 		 132 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  27.93 
 
 		 138 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 133 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  30.28 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 135 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  32.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  31.86 
 
 		 135 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  37.63 
 
 		 129 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  37.63 
 
 		 129 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  30.48 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  32.43 
 
 		 127 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  30.36 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  33.62 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  37.63 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  30.09 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  29.73 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  28.32 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  31.53 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  34.86 
 
 		 131 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  35.29 
 
 		 133 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  29.46 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  31.82 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  34.86 
 
 		 131 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  39.13 
 
 		 133 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  32.71 
 
 		 131 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  32.08 
 
 		 128 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  30.09 
 
 		 143 aa  45.8  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  31.03 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  35.44 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  32.43 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  30.25 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  29.36 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  31.82 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  30.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  30.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  31.62 
 
 		 181 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  32.2 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  30.09 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  35.21 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  32.11 
 
 		 133 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  28.81 
 
 		 138 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>