247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1386 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  58.27 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  55.91 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2461  cytidine deaminase  56.35 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  50 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  42.28 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  42.52 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40.91 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  40.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  40.8 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  42.75 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  40.48 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  35.71 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  42.24 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  40.77 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  42.97 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  35.82 
 
 		 175 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  39.02 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  38.89 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  39.32 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  41.38 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  37.61 
 
 		 135 aa  85.9  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  37.4 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  37.3 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  38.4 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  38.64 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  46.08 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  35.88 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  38.79 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  41.79 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  38.33 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  38.52 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  37.82 
 
 		 388 aa  84  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  36.8 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  40 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  38.46 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  42.02 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  33.6 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  38.84 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  35.51 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  41.67 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  33.87 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  43.31 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  43.31 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  39.52 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  35.54 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  40.35 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  40.94 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  39.39 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  37.69 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  40.94 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  33.88 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  38.28 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  37.14 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  33.06 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>