106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2970 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  89.19 
 
 		 296 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  67.93 
 
 		 295 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  61.72 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  61.72 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  61.72 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  63.73 
 
 		 294 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  61.25 
 
 		 294 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  60 
 
 		 294 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  60.34 
 
 		 294 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  60.34 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  60.34 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  60 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  60 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  58.62 
 
 		 294 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  58.62 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  58.28 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  50.68 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  49.66 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  50.89 
 
 		 295 aa  285  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  51.21 
 
 		 303 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  51.76 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  47.43 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  46.69 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  43.73 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  44.44 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  45.96 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  44.85 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  45.59 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  44.49 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  44.49 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  44.12 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  43.38 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  40.81 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  38.84 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  38.39 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  37.61 
 
 		 131 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  32.46 
 
 		 132 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  35.14 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  36.11 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  29.57 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  36.21 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  30.51 
 
 		 138 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  30 
 
 		 131 aa  50.4  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  35.4 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  26.55 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  32.2 
 
 		 132 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  33.9 
 
 		 181 aa  49.3  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  35.78 
 
 		 127 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  34.82 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  36.05 
 
 		 125 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.96 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  35.78 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  34.51 
 
 		 133 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  33.62 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  33.85 
 
 		 145 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0968  cytidine deaminase  35.65 
 
 		 132 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  34.52 
 
 		 132 aa  45.8  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 135 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  34.21 
 
 		 132 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  34.52 
 
 		 132 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  29.32 
 
 		 133 aa  45.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  31.25 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  37.66 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  30.47 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  33.63 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  33.61 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0828  cytidine deaminase  30.82 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.78081  normal  0.682959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  31.25 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  31.58 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  28.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  34.57 
 
 		 157 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  34.48 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  31.11 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  32.77 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  30.36 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  30.25 
 
 		 138 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  35.24 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  30.97 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  35.14 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  32.22 
 
 		 135 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  30.36 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  30.97 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 138 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  34.29 
 
 		 129 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  33.64 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>