113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2545 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  71.43 
 
 		 294 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  67.93 
 
 		 296 aa  361  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  66.9 
 
 		 296 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  63.57 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  63.57 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  63.57 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  63.48 
 
 		 294 aa  334  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  63.82 
 
 		 294 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  63.82 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  63.82 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  63.82 
 
 		 294 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  62.12 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  60.82 
 
 		 294 aa  318  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  61.77 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  61.43 
 
 		 294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  49.82 
 
 		 295 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  49.47 
 
 		 295 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  52.26 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  49.11 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  50 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  47.1 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  50.74 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  49.63 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  45.92 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  48.16 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  47.99 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  45.11 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  46.69 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  46.69 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  46.32 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  46.32 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  46.32 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  40.18 
 
 		 243 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  34.19 
 
 		 139 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.02 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  29.87 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  35.9 
 
 		 127 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  36.29 
 
 		 145 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  35.9 
 
 		 131 aa  53.5  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 132 aa  53.5  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 139 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  32.79 
 
 		 137 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  29.17 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1257  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 138 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  39.78 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1248  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 138 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.616875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  34.45 
 
 		 138 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1231  cytidine deaminase  37.07 
 
 		 158 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 139 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3945  cytidine deaminase  35.14 
 
 		 136 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.98121  hitchhiker  0.00191304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  36.97 
 
 		 132 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  36.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0763  cytidine deaminase, homotetrameric  34.38 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.499923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  30.7 
 
 		 132 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  33.62 
 
 		 135 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 138 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1590  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 140 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0598974  normal  0.451695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1316  cytidine deaminase  35.04 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.501646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  34.75 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  30.77 
 
 		 132 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  30.77 
 
 		 132 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  27.93 
 
 		 133 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 127 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  24.79 
 
 		 139 aa  46.2  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  46 
 
 		 126 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  33.94 
 
 		 125 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  27.83 
 
 		 131 aa  45.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04940  cytidine deaminase, putative  28.99 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  36.61 
 
 		 130 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  31.9 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  33.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  35.11 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  34.82 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1141  cytidine deaminase  31.86 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.546958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2943  cytidine deaminase  37.17 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04930  cytidine deaminase  35.4 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  34.52 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  34.51 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  34.52 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  33.63 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  29.82 
 
 		 157 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  32.76 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  34.15 
 
 		 144 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  35.96 
 
 		 152 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>