204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_6240 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_6240  predicted protein  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1495  cytidine deaminase  40.17 
 
 
296 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1610  cytidine deaminase  37.95 
 
 
296 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2488  cytidine deaminase  37.05 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2970  cytidine deaminase  39.24 
 
 
296 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0852  cytidine deaminase  36.21 
 
 
295 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.344916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2618  cytidine deaminase  35.65 
 
 
296 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00439525  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003699  cytidine deaminase  36.1 
 
 
295 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2288  cytidine deaminase  37.95 
 
 
297 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2545  cytidine deaminase  41.1 
 
 
295 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2791  cytidine deaminase  36.2 
 
 
296 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02116  cytidine deaminase  35.39 
 
 
295 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2561  cytidine deaminase  39.19 
 
 
294 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37511  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2411  cytidine deaminase  36.2 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0893764  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1637  cytidine deaminase  33.33 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0331465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3023  cytidine deaminase  39.19 
 
 
294 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.676116  normal  0.0127586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2462  cytidine deaminase  39.19 
 
 
294 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2048  cytidine deaminase  35.4 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00991074  normal  0.0337904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1716  cytidine deaminase  35.29 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.483495  normal  0.127463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1974  cytidine deaminase  37.5 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.267602  hitchhiker  0.00286286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2663  cytidine deaminase  35.29 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.188669  hitchhiker  0.00444522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1694  cytidine deaminase  35.29 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1679  cytidine deaminase  35.29 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2481  cytidine deaminase  35.75 
 
 
296 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580648  normal  0.218943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2573  cytidine deaminase  35.75 
 
 
296 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.07896  normal  0.387451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1568  cytidine deaminase  34.84 
 
 
296 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.635046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1257  cytidine deaminase  35.27 
 
 
303 aa  135  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1684  cytidine deaminase  34.43 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.244937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1568  cytidine deaminase  37.27 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2530  cytidine deaminase  37.45 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2422  cytidine deaminase  37.18 
 
 
294 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2418  cytidine deaminase  37.18 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2373  cytidine deaminase  37.18 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2329  cytidine deaminase  36.75 
 
 
294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2746  cytidine deaminase  36.96 
 
 
294 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1505  cytidine deaminase  35.19 
 
 
294 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2438  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02072  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1515  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02031  hypothetical protein  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0828  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2290  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2277  cytidine deaminase  36.05 
 
 
294 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3275  cytidine deaminase  35.62 
 
 
294 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.933628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2449  cytidine deaminase  37.9 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  39.83 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  38.74 
 
 
135 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  37.84 
 
 
131 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  38.33 
 
 
133 aa  63.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  36.28 
 
 
138 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  37.72 
 
 
136 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  38.6 
 
 
132 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  42.06 
 
 
136 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  42.06 
 
 
137 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  38.74 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  38.39 
 
 
129 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  36.7 
 
 
127 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  34.82 
 
 
131 aa  59.7  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  37.69 
 
 
151 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  35.34 
 
 
137 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  34.51 
 
 
144 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  35.19 
 
 
128 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  36.84 
 
 
137 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  40 
 
 
134 aa  58.9  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  36.44 
 
 
133 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  38.66 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  39.05 
 
 
132 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  32.17 
 
 
139 aa  56.6  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  36.52 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  36.52 
 
 
134 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  36.28 
 
 
127 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  35.59 
 
 
149 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  39.29 
 
 
135 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  38.1 
 
 
132 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  38.53 
 
 
129 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  36.94 
 
 
139 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0145  cytidine deaminase  36.59 
 
 
145 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  37.84 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  36.28 
 
 
131 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  33.9 
 
 
139 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  33.02 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04940  cytidine deaminase, putative  31.62 
 
 
138 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  40.74 
 
 
129 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  34.75 
 
 
134 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0657  cytidine deaminase  42.86 
 
 
128 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.589099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  35.04 
 
 
134 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05430  cytidine deaminase  32.76 
 
 
134 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  32.5 
 
 
142 aa  53.1  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  32.43 
 
 
129 aa  53.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  36.7 
 
 
125 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  33.61 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  34.86 
 
 
138 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0998  cytidine deaminase  36.94 
 
 
138 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  34.21 
 
 
132 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  34.26 
 
 
136 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  33.63 
 
 
157 aa  52  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0511  cytidine deaminase  35.71 
 
 
146 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  36.61 
 
 
133 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  36.36 
 
 
132 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>