More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1520 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1520  ROK family protein  100 
 
 		 290 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.969416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2773  N-acetylmannosamine kinase  34.84 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1295  N-acetylmannosamine kinase  34.84 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1404  N-acetylmannosamine kinase  34.84 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.959908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  33.57 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1379  N-acetylmannosamine kinase  31.94 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3659  N-acetylmannosamine kinase  38.06 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3529  N-acetylmannosamine kinase  37.87 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3696  N-acetylmannosamine kinase  37.87 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3599  N-acetylmannosamine kinase  37.87 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3634  N-acetylmannosamine kinase  37.87 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3527  N-acetylmannosamine kinase  37.5 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3554  N-acetylmannosamine kinase  39.19 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0484  ROK familiy protein  37.87 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3517  N-acetylmannosamine kinase  38.83 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3704  N-acetylmannosamine kinase  38.46 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.338423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03082  N-acetylmannosamine kinase  38.46 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0484  N-acetylmannosamine kinase  38.46 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03033  hypothetical protein  38.46 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3410  N-acetylmannosamine kinase  38.46 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4539  N-acetylmannosamine kinase  38.83 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.75 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  31.29 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.77 
 
 		 352 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.85 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.21 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.21 
 
 		 315 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  27.05 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  25.87 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  34.67 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  29.02 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  34.12 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  30.52 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.19 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  27.18 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.47 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  34.39 
 
 		 314 aa  85.5  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  27.91 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.95 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  25.32 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  25.97 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  33.94 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  28.46 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.25 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  32.47 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  26.2 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  25.91 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.86 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.81 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  33.53 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.03 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0354  ROK family protein  27.02 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  22.78 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  30.48 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  25.6 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  30.22 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  28.89 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  33.85 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  27.83 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  26.33 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3453  ROK family protein  24.54 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  26.78 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.02 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  30.58 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.44 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  26.01 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.89 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0411  ROK family protein  26.67 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  24.66 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  33.33 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.7 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  26.06 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  23.42 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  27.65 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  25.45 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6233  transcriptional regulator ROK family  26.25 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  29.41 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  25.63 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.55 
 
 		 402 aa  72.4  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.08 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2107  6-phosphate glucose kinase  26.69 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.44 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  31 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  25.26 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  27.39 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  26.37 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.49 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  29.14 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  27.49 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  35.05 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  23.26 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  26.96 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  28.38 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.18 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  26.62 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  26.96 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  24.23 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  25.32 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>