176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5817 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1082    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  53.02 
 
 
554 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  45.93 
 
 
542 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  42.53 
 
 
578 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  42.46 
 
 
582 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  44.06 
 
 
548 aa  369  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  35.34 
 
 
602 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  29.45 
 
 
590 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  28.9 
 
 
595 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  29.27 
 
 
590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  29.27 
 
 
590 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  29.27 
 
 
590 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  29.58 
 
 
590 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  28.1 
 
 
609 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  28.29 
 
 
592 aa  238  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  27.87 
 
 
591 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  27.98 
 
 
592 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  27.19 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  28.52 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  27.66 
 
 
592 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  28.16 
 
 
596 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  29.33 
 
 
590 aa  233  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  28.16 
 
 
596 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  34.22 
 
 
554 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  28.26 
 
 
542 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  28.65 
 
 
635 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  29.69 
 
 
628 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  28.6 
 
 
581 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.56 
 
 
575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  28.17 
 
 
540 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  28.16 
 
 
502 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  27.6 
 
 
543 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  29.51 
 
 
506 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  24.95 
 
 
544 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  29.27 
 
 
522 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  25.54 
 
 
583 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  28.7 
 
 
622 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.51 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.51 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  29.65 
 
 
608 aa  74.7  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  28.07 
 
 
607 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  26.36 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  28.07 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  28.51 
 
 
614 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  24.3 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  28.07 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  27.22 
 
 
617 aa  73.6  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  26.75 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  28.07 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  26.75 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  23.87 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  27.21 
 
 
546 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  27.11 
 
 
604 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  26.86 
 
 
547 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  27.78 
 
 
625 aa  64.7  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  26.04 
 
 
627 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  25.45 
 
 
618 aa  63.9  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  27.81 
 
 
625 aa  63.9  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.41 
 
 
609 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  25.77 
 
 
1283 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3863  protein of unknown function DUF885  24.48 
 
 
600 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.292852  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  25.76 
 
 
629 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  27.22 
 
 
614 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  24.69 
 
 
595 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  26.11 
 
 
609 aa  61.6  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  25.83 
 
 
605 aa  61.6  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  22.12 
 
 
592 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  30.18 
 
 
561 aa  60.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1193  protein of unknown function DUF885  24.58 
 
 
559 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  25.93 
 
 
496 aa  60.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  25.31 
 
 
615 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  20.74 
 
 
601 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  25.93 
 
 
628 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  25.31 
 
 
615 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  25 
 
 
611 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  25.31 
 
 
602 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  24.84 
 
 
628 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  25.31 
 
 
616 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  27.07 
 
 
624 aa  59.3  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  23.49 
 
 
615 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  27.11 
 
 
609 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  25.31 
 
 
616 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  25.31 
 
 
616 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  25.58 
 
 
613 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  25.31 
 
 
616 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  27.13 
 
 
618 aa  58.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  27.54 
 
 
551 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  26.75 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  23.49 
 
 
615 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  20.74 
 
 
601 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2607  hypothetical protein  25.44 
 
 
547 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.758422  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  26.75 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  20.95 
 
 
583 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  26.25 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  26.75 
 
 
609 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  26.75 
 
 
589 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  24.88 
 
 
602 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>