177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3863 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3863  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
600 aa  1214    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.292852  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02810  hypothetical protein  73.42 
 
 
596 aa  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2038  hypothetical protein  49.05 
 
 
579 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0262  hypothetical protein  43.38 
 
 
621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  30.25 
 
 
598 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  37.91 
 
 
614 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  28.06 
 
 
593 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  27.2 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  32.44 
 
 
607 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  32.82 
 
 
607 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  32.82 
 
 
607 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.84 
 
 
621 aa  97.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.08 
 
 
614 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  37.22 
 
 
227 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  30.68 
 
 
608 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.57 
 
 
614 aa  95.5  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.57 
 
 
614 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  35.81 
 
 
635 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  34.84 
 
 
635 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  35.81 
 
 
635 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  36.52 
 
 
617 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  31.52 
 
 
622 aa  90.5  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  36.65 
 
 
621 aa  90.1  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  32.05 
 
 
611 aa  89  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  30.98 
 
 
618 aa  87.8  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  24.01 
 
 
610 aa  87.4  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  35.47 
 
 
610 aa  87.4  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  31.36 
 
 
615 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.87 
 
 
628 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  36.36 
 
 
621 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  28.28 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  35.26 
 
 
633 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  31.82 
 
 
610 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  30.96 
 
 
602 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  36.88 
 
 
590 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  30.31 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  34.38 
 
 
593 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.33 
 
 
599 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  37.8 
 
 
630 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  35.98 
 
 
605 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  30.43 
 
 
616 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  29.5 
 
 
628 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  30.93 
 
 
615 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.58 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  34.52 
 
 
619 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  30.43 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  30.43 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  30.43 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  30.51 
 
 
615 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.14 
 
 
601 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  30.51 
 
 
615 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.14 
 
 
601 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  32.29 
 
 
625 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  30.38 
 
 
617 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  35.44 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.14 
 
 
601 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.14 
 
 
601 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  32.94 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  23.84 
 
 
609 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  33.33 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  29.44 
 
 
629 aa  77.4  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  28.51 
 
 
613 aa  77  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.67 
 
 
587 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.72 
 
 
589 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  35.19 
 
 
584 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  32.65 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08300  hypothetical protein  36.65 
 
 
568 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104305  normal  0.239062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.57 
 
 
604 aa  76.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  32.65 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.81 
 
 
616 aa  77  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  33.54 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.54 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  32.65 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  32.65 
 
 
609 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.54 
 
 
603 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.81 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  32.54 
 
 
603 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.75 
 
 
591 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2788  hypothetical protein  31.87 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  34.81 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.54 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  34.81 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  34.81 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  34.81 
 
 
611 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.71 
 
 
608 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.13 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  23.88 
 
 
1283 aa  75.1  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  31.18 
 
 
617 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.95 
 
 
599 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  33.33 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  35.44 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.71 
 
 
608 aa  74.3  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  34.25 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05690  hypothetical protein  30.8 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  31.95 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  32.32 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  32.3 
 
 
583 aa  73.9  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  31.95 
 
 
599 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  28.18 
 
 
627 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>