180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2788 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1016    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  30.93 
 
 		 601 aa  203  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  30.23 
 
 		 601 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  30.23 
 
 		 601 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  30 
 
 		 601 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  29.84 
 
 		 1283 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  30.14 
 
 		 603 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  30.14 
 
 		 603 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  30.14 
 
 		 603 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  30.38 
 
 		 603 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  28.78 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  29.9 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  30.73 
 
 		 621 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  29.67 
 
 		 599 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  29.81 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  33.43 
 
 		 610 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  32.47 
 
 		 547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  28.7 
 
 		 589 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  29.03 
 
 		 619 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  29.08 
 
 		 609 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  27.44 
 
 		 609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  29.29 
 
 		 611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  29.52 
 
 		 609 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  29.52 
 
 		 609 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  29.67 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1222  protein of unknown function DUF885  33.06 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  29.05 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  29.05 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.14 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  29.34 
 
 		 629 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  27.68 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  29.2 
 
 		 599 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  28.61 
 
 		 609 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  29.25 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  30.85 
 
 		 602 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.78 
 
 		 551 aa  176  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  30.8 
 
 		 587 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  33.43 
 
 		 611 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  27.63 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  29.65 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  30.65 
 
 		 590 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  30.47 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  28.77 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  29.65 
 
 		 609 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  27.57 
 
 		 635 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  27.91 
 
 		 583 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.33 
 
 		 616 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  27.68 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  27.34 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  28.84 
 
 		 616 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  28.67 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  26.48 
 
 		 595 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  30.83 
 
 		 584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  29.89 
 
 		 617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  25.94 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  27.4 
 
 		 610 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  30.75 
 
 		 618 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  28.09 
 
 		 607 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  28.09 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.69 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  28.09 
 
 		 607 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  25 
 
 		 585 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  26.79 
 
 		 588 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  35.11 
 
 		 605 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  27.98 
 
 		 646 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  27.73 
 
 		 607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  29.26 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  28.18 
 
 		 610 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  27.48 
 
 		 614 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  30.46 
 
 		 609 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.33 
 
 		 614 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  27.55 
 
 		 608 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  27.23 
 
 		 613 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  27.1 
 
 		 614 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  29.85 
 
 		 605 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  26.93 
 
 		 622 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  34.82 
 
 		 618 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  27.55 
 
 		 608 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  28.61 
 
 		 628 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  28.25 
 
 		 602 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  29.22 
 
 		 614 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  26.88 
 
 		 614 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  29.73 
 
 		 615 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  26.88 
 
 		 617 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  29.13 
 
 		 615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  31.21 
 
 		 630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  29.13 
 
 		 615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  29.43 
 
 		 616 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  39.27 
 
 		 628 aa  147  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  28.83 
 
 		 615 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  29.43 
 
 		 616 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  29.43 
 
 		 616 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  29.43 
 
 		 616 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  28.74 
 
 		 627 aa  146  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  29.13 
 
 		 628 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  27.53 
 
 		 605 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  27.68 
 
 		 613 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  29.29 
 
 		 566 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 633 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  26.91 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>