194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1261 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  80.1 
 
 		 609 aa  996    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  71.19 
 
 		 607 aa  931    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  80.2 
 
 		 609 aa  1018    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  80.03 
 
 		 609 aa  1016    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  74.66 
 
 		 609 aa  938    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  78.62 
 
 		 609 aa  1015    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  80.36 
 
 		 611 aa  1022    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  71.76 
 
 		 610 aa  929    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1262    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  79.28 
 
 		 609 aa  1021    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  79.11 
 
 		 609 aa  1019    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  75.49 
 
 		 611 aa  978    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  78.51 
 
 		 609 aa  999    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  78.78 
 
 		 609 aa  1014    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  73.26 
 
 		 616 aa  959    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  74.31 
 
 		 616 aa  955    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  42.76 
 
 		 592 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  42.63 
 
 		 629 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  40.66 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  40.87 
 
 		 635 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  40.69 
 
 		 637 aa  462  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  44.67 
 
 		 621 aa  458  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  39.18 
 
 		 589 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  40.1 
 
 		 1283 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  39.48 
 
 		 619 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  37.66 
 
 		 593 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  37 
 
 		 646 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.44 
 
 		 627 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  36.62 
 
 		 615 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  36.98 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  37.46 
 
 		 614 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  35.25 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  36.32 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  36.02 
 
 		 616 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  36.22 
 
 		 613 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  36.22 
 
 		 624 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.44 
 
 		 615 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.44 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  36.18 
 
 		 616 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  37.88 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  35.99 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  36.18 
 
 		 628 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  38.27 
 
 		 605 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  35.55 
 
 		 587 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.55 
 
 		 603 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.22 
 
 		 603 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.3 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.81 
 
 		 617 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.39 
 
 		 603 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.06 
 
 		 603 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  35.74 
 
 		 613 aa  359  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.66 
 
 		 603 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 617 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.48 
 
 		 619 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  34.53 
 
 		 594 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.9 
 
 		 591 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  33.89 
 
 		 601 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.89 
 
 		 601 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.89 
 
 		 601 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.55 
 
 		 601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  33.99 
 
 		 599 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.01 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  36.69 
 
 		 614 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  36.69 
 
 		 614 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  35.52 
 
 		 618 aa  349  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  35.5 
 
 		 625 aa  349  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  36.31 
 
 		 614 aa  349  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  35.02 
 
 		 618 aa  347  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.94 
 
 		 625 aa  346  7e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  35.78 
 
 		 617 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.24 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  37.55 
 
 		 614 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  38.42 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  38.42 
 
 		 607 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  38.42 
 
 		 607 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  32.84 
 
 		 602 aa  343  8e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  35.69 
 
 		 611 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  35.65 
 
 		 590 aa  340  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.38 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  37.75 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.99 
 
 		 584 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.68 
 
 		 588 aa  336  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  33.81 
 
 		 583 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.17 
 
 		 608 aa  333  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  32.81 
 
 		 613 aa  333  7.000000000000001e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  35.76 
 
 		 628 aa  330  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.39 
 
 		 622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.19 
 
 		 595 aa  326  6e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  35.08 
 
 		 605 aa  326  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  34.38 
 
 		 621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  32.87 
 
 		 633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  33.08 
 
 		 598 aa  303  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  36.1 
 
 		 593 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.87 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.03 
 
 		 551 aa  298  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  31.87 
 
 		 630 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.77 
 
 		 608 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  31.77 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  31.6 
 
 		 610 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  31.87 
 
 		 628 aa  286  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>