194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1186 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  62.05 
 
 		 617 aa  807    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  85.39 
 
 		 616 aa  1103    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  60.27 
 
 		 602 aa  739    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  92.2 
 
 		 615 aa  1190    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  52.31 
 
 		 617 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  68.55 
 
 		 624 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  51.69 
 
 		 618 aa  648    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1277    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  98.7 
 
 		 615 aa  1263    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  85.55 
 
 		 616 aa  1107    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  72.5 
 
 		 618 aa  878    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  98.21 
 
 		 615 aa  1259    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  70.38 
 
 		 625 aa  856    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  85.71 
 
 		 616 aa  1109    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  71.41 
 
 		 613 aa  922    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  71.31 
 
 		 614 aa  922    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  87.91 
 
 		 628 aa  1073    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  85.55 
 
 		 616 aa  1103    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  70 
 
 		 613 aa  923    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  70.63 
 
 		 627 aa  917    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  51.24 
 
 		 625 aa  632  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  51.5 
 
 		 605 aa  581  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  44.74 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  42.78 
 
 		 629 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  49.9 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  49.9 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  49.9 
 
 		 607 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  44.89 
 
 		 614 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  45.05 
 
 		 608 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  44.73 
 
 		 614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  44.55 
 
 		 614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  44.55 
 
 		 617 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  47.31 
 
 		 614 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  44.77 
 
 		 611 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  42.96 
 
 		 622 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  37.76 
 
 		 609 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  37.67 
 
 		 616 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  37.28 
 
 		 609 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  38.14 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  37.74 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  36.29 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  36.33 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  36.29 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  36.29 
 
 		 609 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.77 
 
 		 609 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  35.7 
 
 		 607 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  37.16 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  36.12 
 
 		 616 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  36.09 
 
 		 610 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.71 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.96 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  36.44 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.14 
 
 		 1283 aa  359  7e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  36.68 
 
 		 599 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  39.09 
 
 		 636 aa  355  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  37.93 
 
 		 619 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.38 
 
 		 594 aa  350  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  33.23 
 
 		 635 aa  346  7e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.59 
 
 		 601 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.96 
 
 		 637 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  36.05 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.37 
 
 		 621 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  36.93 
 
 		 630 aa  343  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.1 
 
 		 601 aa  342  9e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.93 
 
 		 628 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.39 
 
 		 629 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.26 
 
 		 601 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  36.87 
 
 		 591 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  35.26 
 
 		 601 aa  339  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  33.88 
 
 		 635 aa  339  8e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.97 
 
 		 589 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.82 
 
 		 635 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  36.98 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  33.77 
 
 		 635 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.56 
 
 		 603 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.44 
 
 		 603 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  37.74 
 
 		 599 aa  334  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.25 
 
 		 583 aa  334  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.92 
 
 		 599 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.58 
 
 		 603 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.56 
 
 		 603 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.28 
 
 		 608 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.28 
 
 		 608 aa  330  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.93 
 
 		 602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  35.86 
 
 		 595 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  35.62 
 
 		 611 aa  326  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.68 
 
 		 587 aa  326  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  34.25 
 
 		 603 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  34.94 
 
 		 592 aa  323  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  36.55 
 
 		 584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.69 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  33.44 
 
 		 605 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  35.79 
 
 		 633 aa  317  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.22 
 
 		 621 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.9 
 
 		 610 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.85 
 
 		 605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  34.67 
 
 		 586 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  30.96 
 
 		 619 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  33.07 
 
 		 609 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  33.16 
 
 		 613 aa  290  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>