194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2356 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1251    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  46.7 
 
 		 611 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  48.68 
 
 		 621 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  40.8 
 
 		 609 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  40.3 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  40.19 
 
 		 611 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  40.62 
 
 		 609 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  40.52 
 
 		 609 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  38.88 
 
 		 616 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  43.1 
 
 		 609 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  43.07 
 
 		 607 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  38.68 
 
 		 616 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  39.67 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  41.97 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  39.67 
 
 		 609 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  39.45 
 
 		 609 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  39.67 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  37.42 
 
 		 635 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  37.56 
 
 		 629 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  38.61 
 
 		 610 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  39.48 
 
 		 609 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  38.03 
 
 		 637 aa  422  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  37.11 
 
 		 603 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  36.95 
 
 		 603 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  38.94 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  38.76 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  38.76 
 
 		 601 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  37.33 
 
 		 603 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  37.19 
 
 		 603 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  38.79 
 
 		 619 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  36.45 
 
 		 601 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  39.92 
 
 		 602 aa  398  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  36.86 
 
 		 603 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  37.21 
 
 		 594 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  36.14 
 
 		 591 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  37.72 
 
 		 599 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  40.28 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  39.74 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.97 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.14 
 
 		 1283 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  37.54 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  41.39 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  39.73 
 
 		 587 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  39.38 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  37.62 
 
 		 592 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  36.54 
 
 		 595 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.68 
 
 		 589 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  38.15 
 
 		 583 aa  343  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  35.92 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  36.8 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  34.16 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  35.29 
 
 		 646 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  39.11 
 
 		 621 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  36.82 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  36.47 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  40.88 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  36.65 
 
 		 608 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  39.29 
 
 		 584 aa  327  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  39.64 
 
 		 593 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  34.98 
 
 		 625 aa  316  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  35.22 
 
 		 586 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  41 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  31.34 
 
 		 613 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  30.14 
 
 		 614 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.28 
 
 		 617 aa  303  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  31.39 
 
 		 615 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  30.96 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  30.95 
 
 		 615 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  30.81 
 
 		 615 aa  300  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  38.17 
 
 		 551 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  31.71 
 
 		 618 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.46 
 
 		 613 aa  297  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  31.08 
 
 		 617 aa  296  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  37.42 
 
 		 610 aa  293  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  30.52 
 
 		 616 aa  293  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  30.93 
 
 		 616 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  31.99 
 
 		 608 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  30.93 
 
 		 616 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  30.68 
 
 		 627 aa  291  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 625 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  30.36 
 
 		 616 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  37.94 
 
 		 566 aa  289  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.78 
 
 		 628 aa  288  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  33.52 
 
 		 614 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  33.14 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  32.36 
 
 		 611 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  33.97 
 
 		 593 aa  280  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  41.28 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  31.62 
 
 		 628 aa  280  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  33.15 
 
 		 614 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  33.04 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 607 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.84 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.65 
 
 		 635 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.65 
 
 		 635 aa  277  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  34.1 
 
 		 624 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>