195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4378 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1242    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  61.81 
 
 		 601 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  56.62 
 
 		 599 aa  679    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  60.68 
 
 		 601 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  60.87 
 
 		 601 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  56.32 
 
 		 602 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  60.87 
 
 		 601 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  55.48 
 
 		 619 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  56.08 
 
 		 603 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  57.55 
 
 		 583 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  56.25 
 
 		 603 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  59.39 
 
 		 594 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  55.38 
 
 		 591 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  60.19 
 
 		 603 aa  675    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  60.76 
 
 		 603 aa  680    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  60.76 
 
 		 603 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  55.57 
 
 		 599 aa  665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  54.61 
 
 		 599 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  51.29 
 
 		 589 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  47.09 
 
 		 588 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  45.5 
 
 		 587 aa  542  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  47.39 
 
 		 590 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  42.83 
 
 		 613 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  46.14 
 
 		 621 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  43.64 
 
 		 1283 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  42.17 
 
 		 598 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  39.49 
 
 		 593 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  39.83 
 
 		 586 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  39.92 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  34.74 
 
 		 609 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  34.87 
 
 		 616 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  36.54 
 
 		 619 aa  350  5e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.1 
 
 		 616 aa  349  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  33.57 
 
 		 609 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  33.39 
 
 		 609 aa  347  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.87 
 
 		 611 aa  346  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.22 
 
 		 611 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.87 
 
 		 585 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.16 
 
 		 609 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  33.39 
 
 		 609 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  33.91 
 
 		 607 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  33.22 
 
 		 609 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.39 
 
 		 609 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  32.64 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  32.81 
 
 		 609 aa  339  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  37.16 
 
 		 635 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  36.9 
 
 		 621 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  37.19 
 
 		 629 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  37.16 
 
 		 637 aa  331  3e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  35.66 
 
 		 615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  31.23 
 
 		 610 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  35.86 
 
 		 615 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.19 
 
 		 609 aa  326  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.67 
 
 		 627 aa  326  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  35.15 
 
 		 615 aa  326  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.01 
 
 		 611 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  35.01 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  34.56 
 
 		 616 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  35.23 
 
 		 616 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  34.56 
 
 		 616 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.56 
 
 		 616 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  36.59 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  33.77 
 
 		 610 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.43 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  41.88 
 
 		 628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  32.54 
 
 		 592 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  34.11 
 
 		 614 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  34.5 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  34.51 
 
 		 624 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  35.97 
 
 		 625 aa  311  2.9999999999999997e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.1 
 
 		 613 aa  309  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  33.49 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  31.84 
 
 		 566 aa  306  9.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  34.93 
 
 		 618 aa  299  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  32.69 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  46.25 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43434  predicted protein  33.33 
 
 		 593 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996285  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.3 
 
 		 602 aa  293  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.27 
 
 		 625 aa  291  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  33.46 
 
 		 614 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  32.66 
 
 		 589 aa  289  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  32.96 
 
 		 608 aa  289  9e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  32.66 
 
 		 614 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  33.09 
 
 		 607 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  32.1 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  33.09 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  41.11 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  33.09 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  32.66 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  32.96 
 
 		 608 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  32.12 
 
 		 614 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  32.1 
 
 		 611 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  31.93 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  31.37 
 
 		 605 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  31.45 
 
 		 593 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  35.79 
 
 		 628 aa  277  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.96 
 
 		 621 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  31.33 
 
 		 646 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0692  protein of unknown function DUF885  36.01 
 
 		 547 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>